От 01.01.2012 г. две общини от област Кюстендил – Рила и Кочериново са включени в териториалния обхват на РИОСВ-Благоевград. Още 13 общини от Благоевградска област – Благоевград, Белица, Банско, Гоце Делчев, Гърмен, Кресна, Петрич, Разлог, Симитли, Струмяни, Сандански, Хаджидимово и Якоруда са обхвата за контрол на РИОСВ-Благоевград, а община Сатовча е към РИОСВ-Смолян.
В ДВ бр.103 от 23 декември 2011 г. е публикуван Правилник за устройството и дейността на регионалните инспекции по околната среда и водите.
Съгласно новия правилник в териториалния обхват на Регионалната инспекция по околната среда и водите – Благоевград са включени общините Рила и Кочериново. Правилникът влиза в сила от 01.01.2012г.
Започнатите, но не приключили до влизане в сила на този правилник административни производства пред РИОСВ-Перник, за административна област Кюстендил, община Рила и община Кочериново се довършват от РИОСВ-Перник.