С лиценз издаден от министъра на околната среда и водите, Зоопарк Благоевград става Зоологическа градина. Лицензът удостоверява годността на зоологическата градина за опазване на диви животински видове извън естествената им среда, чрез отглеждането и размножаването им при контролирани условия.
Лицензът е валиден до 2021 г., а неразделна част от него са редица условия, които собственикът – Община Благоевград трябва да изпълни. Така например, в 6 месечен срок трябва да се систематизира информацията за произхода на животните, същите да бъдат маркирани, като за всеки отделен екземпляр се създаде досие, който да се актуализира при настъпване на промени. Съгласно Наредба № 6/2006 г. за минималните изисквания и условия за отглеждане на животни в зоологически градини и центрове за отглеждане и размножаване на защитени видове животни, за много от видовете трябва да бъдат осигурени подходяща среда и условия за отглеждане, а храненето на всички животни да става по утвърдени дажбени таблици.
В срок до 1 година от издаването на лиценза зоопаркът трябва да има персонал с професионална квалификация, да бъде осигурен изолатор за преглед, третиране, възстановяване и карантина на животни в изолация.
До 2 години трябва да се осигури участието на зоопарка в образователни и възпитателни дейности по опазване на видовете животни, както и участие в научни изследвания от значение за опазване и отглеждане на видовете.